Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPP4R2Q9NY27 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP4R2Q9NY27 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms