Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIC8BQ9NVN3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIC8BQ9NVN3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms