Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO28Q9NVF7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO28Q9NVF7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms