Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDFIP2Q9NV92 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDFIP2Q9NV92 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms