Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
DUOX2Q9NRD8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
DUOX2Q9NRD8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
DUOX2Q9NRD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms