Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VTA1Q9NP79 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VTA1Q9NP79 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VTA1Q9NP79 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms