Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ3

RAVER2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAVER2Q9HCJ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAVER2Q9HCJ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAVER2Q9HCJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAVER2Q9HCJ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAVER2Q9HCJ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAVER2Q9HCJ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAVER2Q9HCJ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAVER2Q9HCJ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAVER2Q9HCJ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAVER2Q9HCJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAVER2Q9HCJ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAVER2Q9HCJ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAVER2Q9HCJ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms