Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC3GQ9HC16 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC3GQ9HC16 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms