Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POPDC2Q9HBU9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms