Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARVBQ9HBI1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PARVBQ9HBI1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms