Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPV4Q9HBA0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRPV4Q9HBA0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms