Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SP110Q9HB58 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SP110Q9HB58 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP110Q9HB58 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms