Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COG4Q9H9E3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG4Q9H9E3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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