Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I2

ZHX3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZHX3Q9H4I2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZHX3Q9H4I2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZHX3Q9H4I2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms