Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNMDQ9H2S6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNMDQ9H2S6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms