Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCL3Q9H2J4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCL3Q9H2J4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms