Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NYXQ9GZU5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NYXQ9GZU5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms