Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CCDC90BQ9GZT6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC90BQ9GZT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms