Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SENP6Q9GZR1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SENP6Q9GZR1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms