Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHACTR1Q9C0D0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHACTR1Q9C0D0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms