Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIPCQ9C0C6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIPCQ9C0C6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms