Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM4Q9C037 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms