Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NMES1Q9C002 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMES1Q9C002 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms