Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIFKQ9BYG3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NIFKQ9BYG3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms