Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL25A1Q9BXS0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL25A1Q9BXS0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL25A1Q9BXS0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms