Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSM14BQ9BX40 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSM14BQ9BX40 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms