Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHCHD7Q9BUK0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD7Q9BUK0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms