Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NDFIP1Q9BT67 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDFIP1Q9BT67 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms