Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C16orf70Q9BSU1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C16orf70Q9BSU1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C16orf70Q9BSU1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C16orf70Q9BSU1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C16orf70Q9BSU1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms