Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C2orf88Q9BSF0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms