Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM79Q9BSE2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM79Q9BSE2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms