Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GINS3Q9BRX5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GINS3Q9BRX5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms