Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RIOK1Q9BRS2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RIOK1Q9BRS2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIOK1Q9BRS2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms