Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBA1CQ9BQE3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms