Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3GL2Q99962 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3GL2Q99962 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms