Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SRPK1Q96SB4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRPK1Q96SB4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms