Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNGAP1Q96PV0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNGAP1Q96PV0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNGAP1Q96PV0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms