Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZIM3Q96PE6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIM3Q96PE6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms