Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNDC3BQ96NL0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNDC3BQ96NL0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms