Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C8orf49Q96NF6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf49Q96NF6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms