Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP57Q96MR6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CFAP57Q96MR6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms