Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM20AQ96MK3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM20AQ96MK3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms