Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM47Q96LD4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms