Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNX22Q96L94 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX22Q96L94 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms