Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EP400Q96L91 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EP400Q96L91 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms