Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CALR3Q96L12 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALR3Q96L12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms