Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A4AQ96JQ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A4AQ96JQ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A4AQ96JQ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms