Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VPS50Q96JG6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS50Q96JG6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms