Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF479Q96JC4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF479Q96JC4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF479Q96JC4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF479Q96JC4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF479Q96JC4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF479Q96JC4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms