Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NSL1Q96IY1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NSL1Q96IY1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms